根據《教育部高等教育司關于開展2025年度普通高等學校本科專業(yè)設置工作的通知》(教高司函〔2025〕3號)的規(guī)定，北京交通大學現對2025年2個擬申報本科新專業(yè)、2個預申報本科新專業(yè)及6個擬撤銷專業(yè)。
| 序號 | 學院 | 申報新專業(yè)名稱 |
| 1 | 智能 | 智能科學與技術 |
| 2 | 低空技術與工程 |
| 序號 | 學院 | 預申報新專業(yè)名稱 |
| 1 | 馬院 | 馬克思主義理論 |
| 2 | 法 | 紀檢監(jiān)察 |
| 序號 | 學院 | 申請撤銷專業(yè)名稱 |
| 1 | 電信 | 電子信息工程 |
| 2 | 環(huán)境 | 給排水科學與工程 |
| 3 | 物工 | 生物信息學 |
| 4 | 材料化學 | |
| 5 | 馬院 | 思想政治教育 |
| 6 | 語傳 | 漢語言 |
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